SeqAn3  3.0.1
The Modern C++ library for sequence analysis.
Class Index
a | b | c | d | e | f | g | h | i | l | m | n | o | p | q | r | s | t | u | v | w
  a  
compatible (seqan3)   gap_score (seqan3)   pod_tuple< type0 > (seqan3)   standard_layout (seqan3)   
concatenated_sequences (seqan3)   
  h  
pod_tuple< type0, types... > (seqan3)   static_band (seqan3)   
aa10li (seqan3)   configuration (seqan3)   predicate (std)   strata (seqan3::search_cfg)   
aa10murphy (seqan3)   const_iterable_range (seqan3)   hash< alphabet_t > (std)   alignment_file_header::program_info_t (seqan3)   stream_REMOVEME (seqan3)   
aa20 (seqan3)   const_reference (seqan3)   hash< seqan3::dynamic_bitset< cap > > (std)   pseudo_random_access_iterator (seqan3)   strict_weak_order (std)   
aa27 (seqan3)   const_reference< rng_t > (seqan3)   hash< urng_t > (std)   pseudo_random_access_range (seqan3)   structure_file_input (seqan3)   
aligned_allocator (seqan3)   constructible_from (std)   
  i  
  q  
structure_file_input_default_traits_aa (seqan3)   
aligned_ends (seqan3::align_cfg)   container (seqan3)   structure_file_input_default_traits_rna (seqan3)   
aligned_sequence (seqan3)   convertible_to (std)   implicitly_convertible_to (seqan3)   qualified (seqan3)   structure_file_input_format (seqan3)   
alignment_coordinate (seqan3)   copy_constructible (std)   innermost_value_type (seqan3)   quality_alphabet (seqan3)   structure_file_input_options (seqan3)   
alignment_file_header (seqan3)   copyable (std)   input_directory_validator (seqan3)   quality_base (seqan3)   structure_file_input_traits (seqan3)   
alignment_file_input (seqan3)   
  d  
input_file_validator (seqan3)   
  r  
structure_file_output (seqan3)   
alignment_file_input_default_traits (seqan3)   input_stream_over (seqan3)   structure_file_output_format (seqan3)   
alignment_file_input_format (seqan3)   debug_stream_type (seqan3)   insertion (seqan3::search_cfg)   random_access_container (seqan3)   structure_file_output_options (seqan3)   
alignment_file_input_options (seqan3)   deep (seqan3::views)   integral (std)   aligned_allocator::rebind (seqan3)   structured_aa (seqan3)   
alignment_file_input_traits (seqan3)   default_constructible (std)   invalid_alignment_configuration (seqan3)   record (seqan3)   structured_rna (seqan3)   
alignment_file_output (seqan3)   deletion (seqan3::search_cfg)   invalid_char_assignment (seqan3)   ref_info_not_given (seqan3)   substitution (seqan3::search_cfg)   
alignment_file_output_format (seqan3)   derived_from (std)   invocable (std)   reference (seqan3)   swappable (std)   
alignment_file_output_options (seqan3)   destructible (std)   io_error (seqan3)   reference< it_t > (seqan3)   swappable_with (std)   
alignment_range (seqan3)   difference_type (seqan3)   is_constexpr_default_constructible (seqan3)   reference< rng_t > (seqan3)   
  t  
alignment_range::alignment_range_iterator (seqan3)   difference_type< it_t > (seqan3)   is_constexpr_default_constructible< t > (seqan3)   regex_validator (seqan3)   
alignment_result (seqan3)   difference_type< rng_t > (seqan3)   is_execution_policy (seqan3)   regular (std)   to_chars_result (std)   
alphabet (seqan3)   dna15 (seqan3)   iterator_tag (seqan3)   regular_invocable (std)   too_few_arguments (seqan3)   
alphabet (seqan3::custom)   dna3bs (seqan3)   
  l  
relation (std)   too_many_arguments (seqan3)   
alphabet< char_type > (seqan3::custom)   dna4 (seqan3)   remove_rvalue_reference (seqan3)   total (seqan3::search_cfg)   
alphabet< uint_type > (seqan3::custom)   dna5 (seqan3)   lower_bound (seqan3)   required_option_missing (seqan3)   totally_ordered (std)   
alphabet_base (seqan3)   dot_bracket3 (seqan3)   
  m  
reservible_container (seqan3)   totally_ordered_with (std)   
alphabet_base< derived_type, 1ul, char_t > (seqan3)   dssp9 (seqan3)   result (seqan3::align_cfg)   transformation_trait (seqan3)   
alphabet_proxy (seqan3)   dynamic_bitset (seqan3)   mask (seqan3)   rna15 (seqan3)   trivial (seqan3)   
alphabet_tuple_base (seqan3)   
  e  
masked (seqan3)   rna4 (seqan3)   trivially_copyable (seqan3)   
alphabet_variant (seqan3)   match_score (seqan3)   rna5 (seqan3)   trivially_destructible (seqan3)   
aminoacid_alphabet (seqan3)   end_gaps (seqan3)   max_error (seqan3::search_cfg)   rna_structure_alphabet (seqan3)   tuple_element< elem_no, seqan3::alignment_file_input< traits_type, selected_field_ids, valid_formats > > (std)   
aminoacid_base (seqan3)   equality_comparable (std)   max_error (seqan3::align_cfg)   rvalue_reference (seqan3)   tuple_element< elem_no, seqan3::record< field_types, field_ids > > (std)   
aminoacid_empty_base (seqan3)   equality_comparable_with (std)   max_error_rate (seqan3::search_cfg)   rvalue_reference< it_t > (seqan3)   tuple_element< i, tuple_t > (std)   
aminoacid_scoring_scheme (seqan3)   explicitly_convertible_to (seqan3)   mismatch_score (seqan3)   rvalue_reference< rng_t > (seqan3)   tuple_like (seqan3)   
argument_parser (seqan3)   
  f  
mode (seqan3::search_cfg)   
  s  
tuple_size< seqan3::alignment_file_input< traits_type, selected_field_ids, valid_formats > > (std)   
argument_parser_compatible_option (seqan3)   mode (seqan3::align_cfg)   tuple_size< seqan3::record< field_types, field_ids > > (std)   
argument_parser_meta_data (seqan3)   fields (seqan3)   movable (std)   sam_dna16 (seqan3)   tuple_size< tuple_t > (std)   
argument_parsing (seqan3::custom)   file_open_error (seqan3)   move_constructible (std)   sam_tag_dictionary (seqan3)   type_conversion_failed (seqan3)   
arithmetic (seqan3)   file_validator_base (seqan3)   
  n  
sam_tag_type (seqan3)   type_identity (std)   
arithmetic_range_validator (seqan3)   floating_point (seqan3)   same_as (std)   
  u  
assignable_from (std)   fm_index (seqan3)   named_enumeration (seqan3)   scoring (seqan3::align_cfg)   
  b  
fm_index_cursor (seqan3)   nucleotide_alphabet (seqan3)   scoring_scheme (seqan3)   unary_type_trait (seqan3)   
fm_index_cursor_specialisation (seqan3)   nucleotide_base (seqan3)   scoring_scheme_base (seqan3)   unexpected_end_of_input (seqan3)   
back_end_first (seqan3)   fm_index_specialisation (seqan3)   nucleotide_scoring_scheme (seqan3)   semialphabet (seqan3)   ungapped (seqan3)   
back_end_second (seqan3)   format_bam (seqan3)   
  o  
semialphabet_any (seqan3)   unhandled_extension_error (seqan3)   
band (seqan3::align_cfg)   format_embl (seqan3)   semiregular (std)   unknown_option (seqan3)   
bi_fm_index (seqan3)   format_error (seqan3)   option_declared_multiple_times (seqan3)   sequence_container (seqan3)   unsequenced_policy (seqan3)   
bi_fm_index_cursor (seqan3)   format_fasta (seqan3)   output (seqan3::search_cfg)   sequence_end_gap_specifier_base (seqan3)   unsigned_integral (std)   
bi_fm_index_cursor_specialisation (seqan3)   format_fastq (seqan3)   output_directory_validator (seqan3)   sequence_file_input (seqan3)   upper_bound (seqan3)   
bi_fm_index_specialisation (seqan3)   format_genbank (seqan3)   output_file_validator (seqan3)   sequence_file_input_default_traits_aa (seqan3)   
  v  
bin_literal (seqan3)   format_sam (seqan3)   output_stream_over (seqan3)   sequence_file_input_default_traits_dna (seqan3)   
bitcompressed_vector (seqan3)   format_vienna (seqan3)   overflow_error_on_conversion (seqan3)   sequence_file_input_format (seqan3)   validation_failed (seqan3)   
boolean (std)   forwarding_range (seqan3)   
  p  
sequence_file_input_options (seqan3)   validator (seqan3)   
builtin_character (seqan3)   from_chars_result (std)   sequence_file_input_traits (seqan3)   value_list_validator (seqan3)   
  c  
front_end_first (seqan3)   parallel_policy (seqan3)   sequence_file_output (seqan3)   value_type (seqan3)   
front_end_second (seqan3)   parallel_unsequenced_policy (seqan3)   sequence_file_output_format (seqan3)   value_type< it_t > (seqan3)   
cereal_archive (seqan3)   
  g  
parse_error (seqan3)   sequence_file_output_options (seqan3)   value_type< rng_t > (seqan3)   
cereal_input_archive (seqan3)   parser_design_error (seqan3)   sequenced_policy (seqan3)   
  w  
cereal_output_archive (seqan3)   gap (seqan3)   parser_invalid_argument (seqan3)   shape (seqan3)   
cereal_text_archive (seqan3)   gap (seqan3::align_cfg)   phred42 (seqan3)   signed_integral (std)   weakly_assignable_from (seqan3)   
cerealisable (seqan3)   gap_decorator (seqan3)   phred63 (seqan3)   size_type (seqan3)   writable_alphabet (seqan3)   
cigar (seqan3)   gap_decorator::gap_decorator_iterator (seqan3)   phred68legacy (seqan3)   size_type< it_t > (seqan3)   writable_quality_alphabet (seqan3)   
cigar_op (seqan3)   gap_erase_failure (seqan3)   pipeable_config_element (seqan3)   size_type< rng_t > (seqan3)   writable_semialphabet (seqan3)   
common_reference_with (std)   gap_open_score (seqan3)   plain_byte_alphabet (sdsl)   small_string (seqan3)   wuss (seqan3)   
common_with (std)   gap_scheme (seqan3)   pod_tuple (seqan3)   small_vector (seqan3)   
a | b | c | d | e | f | g | h | i | l | m | n | o | p | q | r | s | t | u | v | w